为了在饲养过程中减少疫病发生，貉子养殖户应坚持定期对貉舍消毒。鉴于春季是各种病菌复活及滋生的初始阶段，这个阶段采取消毒杀菌的措施当是最佳时机，将起到事半功倍的作用。而且，这时养殖户所饲养的绝大多数为种貉，数量较少，便于操作。
在珍稀皮毛动物养殖很出名的河北乐亭县，很多养殖户采取用柴火烧、喷杀菌药和撒石灰的方法消毒，效果不错，而且投入很小。具体步骤：用各类柴草堆放于貉舍下点燃，让其火焰充分烧熏于貉舍内部，3分钟左右即可，一般2个月一次；也可用84消毒液喷雾消毒，按照要求比例对水后均匀喷施貉舍的内部，不留死角，条件允许可每月实施一次。无论采取以上哪种方法，之后必须在貉舍的底部地面撒放生石灰，以浅薄覆盖为宜，一周更换一次，直至深秋。
在选用消毒液消毒时，不可使用酒精、来苏儿等气味较大且不易挥发的药液。在消毒时，不能有貉子在貉舍内，以免受到惊吓，造成伤害。只要养殖户消毒措施到位、及时，并按期注射疫苗，一般不会发生传染性疾病。
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